Сортовая чистота посевного материала критически важна для будущего урожая, она также будет определять ценность выращенного продукта на рынке.
Не всегда легко установить чистоту сорта по морфологическим признакам семян или зерна, а пробное выращивание не рационально из-за затраты времени и труда.
Современная технология определения сорта – это специфический анализ фрагментов амплификации ДНК. Основанная на полимеразной цепной реакции (ПЦР) методика вышла из криминалистических лабораторий и служила сначала для установления личности. Каждый сорт имеет свои специфические генетические маркеры – определенные участки хромосом, которые имеют характерную длину для каждого сорта. Амплификация в ПЦР таких участков с последующим разделением образованных фрагментов ДНК по длине будет давать уникальную для сорта картину. Для разделения и визуализации используется гель-электрофорез.
Еще несколько лет назад это был трудоемкий процесс с заливкой гелей, филигранным нанесением пробы, подбором условий разделения фрагментов, визуализацией с высокотоксичными красителями. Сейчас задача упрощается благодаря автоматическим системам капиллярного электрофореза на многоразовых картриджах. Удачным сравнением будет эволюция фотографии: от старинных фотоаппаратов с ручным подбором параметров и проявки фото в темной комнате с ванночками реагентов – до современных камер в смартфонах, которые делают отличные фото просто одним прикосновением.
Для надежного определения сорта необходимо не только современное оборудование, но и качественные реагенты. Наборы реактивов для выделения ДНК от QIAGEN (Германия) обеспечивают качественную очистку ДНК от примесей, которые могут мешать последующим этапам анализа, и гарантируют достаточное для определения сорта количество очищенной ДНК.
Для специфической амплификации определенных фрагментов идеально подходят наборы реагентов для ПЦР QIAGEN, обеспечивающие высокий выход продукта и специфичность реакции без тщательного подбора условий.
Мы предлагаем нашим клиентам синтез на заказ специфических сортовых праймеров: синтез выполняется в США на современном оборудовании с эффективной очисткой.
Что необходимо?
TissueLyser II – шариковая мельница, которая позволяет измельчать одновременно от 1 до 48 образцов растительного материала без риска загрязнения. Для измельчения растительный материал помещается в пробирку с металлическим шариком, интенсивные колебания мельницы с заданной частотой и амплитудой обеспечивают эффективную гомогенизацию.
QIAcube connect – полностью автоматизированный прибор для выделения ДНК на 12 или меньше образцов. Использует проверенные наборы QIAGEN на технологии силикамембранних колонок.
Вам не нужны отдельные наборы реагентов для автоматической станции: просто загрузите в прибор набор для ручного выделения, образцы, расходный пластик, отсканируйте штрих-код на упаковке набора и через 20–60 мин (в зависимости от выбранного набора и количества образцов) получите уведомление на Ваш смартфон или планшет о готовности протокола выделения.
QIAamplifier 96 – термоциклер, который обеспечивает точную и эффективную амплификацию фрагментов ДНК с помощью ПЦР. Крышка с регулировкой обеспечивает совместимость с любым типом пробирок или планшетов, высокая скорость нагрева/охлаждения позволяет выполнить 30 циклов ПЦР за 45 мин.
Низкий уровень шума и удобный сенсорный экран обеспечивают комфорт в пользовании.
QIAxcel Advanced – это система, которая обеспечивает полностью автоматизированный и чувствительный капиллярный электрофорез с высоким разрешением до 96 проб одновременно.
Готовые к использованию гелевые картриджи содержат 12 отдельных микроканалов со встроенной гелевой матрицей для быстрого разделения фрагментов ДНК с высоким разрешением.
Высокая чувствительность позволяет получать более надежные результаты при низких концентрациях нуклеиновых кислот. Разрешение до 3–5 bp для фрагментов, меньших 0,5 kb, обеспечивает более точные результаты по сравнению с традиционными методами и более достоверную интерпретацию данных.
Расходы образца менее 0,1 мкл на анализ сохраняют материал для дальнейшего анализа.
96 проб с размером фрагмента от 15 bp до 3 kb обрабатываются менее чем за 30 минут.
Qiagen – наборы для выделения ДНК, всемирно признанное качество. Обеспечивают выделение ДНК высокого качества из минимальных навесок материала.
Qiagen – готовы реакционные смеси, позволяют эффективно амплифицировать только специфические фрагменты ДНК с минимальной оптимизацией условий реакции.
Qiagen – картриджи и расходные материалы для QIAxcel.
Синтез праймеров.